Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PdgfrbP05622 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PdgfrbP05622 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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