Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cited2O35740 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms