Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4930544D05RikJ3QK56 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms