Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn34c3J3QJW5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms