Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20828J3KMI7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm20828J3KMI7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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