Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp17lcG5E8I7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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