Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm28038F7BCN9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms