Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Myo5cE9Q1F5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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