Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Krt78E9Q0F0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms