Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Zscan18E9PUD6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zscan18E9PUD6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms