Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mfap1aC0HKD8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mfap1aC0HKD8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms