Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Phf11bB4XVQ1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Phf11bB4XVQ1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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