Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf11cB4XVP9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms