Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Clrn2B2RVW2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clrn2B2RVW2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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