Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Samt1A2BED8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Samt1A2BED8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Samt1A2BED8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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