Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramel3A2AHA7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms