Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rps6ka4Q9Z2B9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms