Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DKK4Q9UBT3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms