Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VapbQ9QY76 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms