Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Gde1Q9JL56 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gde1Q9JL56 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms