Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tuba8Q9JJZ2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms