Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Aff4Q9ESC8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Aff4Q9ESC8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms