Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms