Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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