Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms