Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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