Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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