Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms