Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms