Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc5Q9CQA1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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