Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms