Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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