Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atl3Q91YH5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms