Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Snx15Q91WE1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms