Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Klhdc3Q8VEM9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klhdc3Q8VEM9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms