Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep57l1Q8VDS7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep57l1Q8VDS7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms