Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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