Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntrobQ8CB62 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms