Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fbxo48Q8CAT8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms