Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Aph1bQ8C7N7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Aph1bQ8C7N7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Aph1bQ8C7N7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Aph1bQ8C7N7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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