Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp20Q8C6M1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp20Q8C6M1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms