Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccser1Q8C0C4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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