Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ubash3bQ8BGG7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubash3bQ8BGG7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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