Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ChfrQ810L3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms