Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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