Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1bQ7TSF1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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