Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Actn1Q7TPR4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms