Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Sbno1Q689Z5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Sbno1Q689Z5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms