Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PtprdQ64487 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PtprdQ64487 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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PtprdQ64487 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PtprdQ64487 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PtprdQ64487 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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