Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms